Kluczowe cechy i wydajność | |
SZEROKIE I JEDNOLITE POKRYCIE GENOMEM EGZOMU I MITOCHONDRIALNEGO | Średnia głębokość ≥ 100 x |
Wysoce jednolite pokrycie całego egzomu (~20 000 genów), +/-10 pz granice egzon-intron i kompletny genom mitochondrialny (37 genów); z ≥ 98,0% regionami docelowymi pokrytymi przy ≥ 20 x | |
ZWIĘKSZONY ZASIĘG REGIONÓW ISTOTNYCH KLINICZNIE | ~ 8000 genów związanych z chorobą (OMIM®, HGMD®, CENTOGENE Biodatabank), z ≥ 99,0% regionami docelowymi pokrytymi przy ≥ 20 x |
> 99,0% wszystkich znanych klinicznie istotnych wariantów w regionach kodujących i niekodujących (HGMD®, ClinVar, CENTOGENE’s Biodatabank dla chorób rzadkich i neurodegeneracyjnych) | |
TYPY WARIANTÓW | Wysoce czułe i swoiste wykrywanie SNV, InDels, CNV od poziomu eksonu do zmian na poziomie cytogenomicznym, UPD* i mtDNA z heteroplazmią ≥ 15,0% |
Wrażliwość SNV i InDels (≤ 55 pz) > 99,6% CNV (≥ 3 egzony)** > 95,0% | |
Gwarantowana swoistość > 99,9 % dla wszystkich zgłoszonych wariantów*** | |
SZCZEGÓŁY TECHNICZNE | Technologia sekwencjonowania nowej generacji (NGS) sparowanego końca Illumina (2 x 150 pz) |
Przechwytywanie egzomu za pomocą specjalnie zaprojektowanych odczynników opartych na egzomie Twist® Human Core Exome, z 18–20 Gb danych sekwencjonowania generowanych na pacjenta | |
Genom jądrowy dopasowany do GRCh37/hg19 Zespół genomu ludzkiego | |
Genom mitochondrialny dopasowany do zmienionej sekwencji referencyjnej Cambridge (rCRS) ludzkiego mitochondrialnego DNA (NC_012920) |